Verdinegros y millonarios se enfrentaron solamente dos veces en Primera División en esta era moderna, con un triunfo para cada, que se dio siendo locales.
El primer choque fue el 26 de agosto de 2007, por la 4ta fecha del Torneo Apertura. Se jugó en el Hilario Sánchez y el Verdinegro ganó 1-0 con el gol de Sebastián Brusco de tiro libre. En ese partido, el arquero Juan Ojeda le atajó un penal a Luis Tonelotto.
Mientras que el segundo duelo fue en Monumental, el 2 de marzo de 2008, también por la 4ta fecha pero del Clausura. Fue victoria de River por 3 a 2, con goles de Sebastián Abreu, Diego Buonanotte y Cristian Nasuti. Para San Martín descontaron Brusco (de penal) y Martín Bravo. Ese partido fue suspendido en el segundo tiempo por la intensa lluvia con River ganando 3-1, y que un par de semanas después se completó y allí Bravo marcó el descuento sanjuanino.