Huarpes -gran candidato- cayó por penales ante Villa Porres. Mientras que el SEC venció 3-1 a Cooperativa Caucete, convirtiéndose en resultados más que sorpresivos en la Copa San Juan 2016. Por cuartos de final, Villa Porres dio la nota al derrotar en penales 4-2 a Huarpes.
SEC venció de forma ajustada Cooperativa Caucete por 3-1.