-Martel
Es la parte residual del anterior megajuicio. Se trata de exmilitares que cumplieron funciones en el RIM 22 para la época del último golpe militar. A los acusados se les atribuye haber formado parte del aparato represivo que actuó en la provincia durante la última dictadura. Entre otras víctimas está el caso de la joven Marie Anne Erize, desaparecida luego de que fuera secuestrada en la vereda de una bicicletería en Trinidad.
-Compulsa Bustos
�Se trata de un proceso que es continuidad de la llamada causa Bustos, en la que aparecen como víctimas, por ejemplo, el exgobernador José Luis Gioja y el cortista José Soria Vega. En esta causa, sumando las de la anterior, hay 62 víctimas,, incluso hay dos que fueron violadas.
-Ripoll
Se trata de nuevas víctimas que fueron detenidas después del golpe militar. Entre las personas que habrían sufrido vejaciones y torturas se encuentran exempleados del Hospital Rawson, gremialistas y hasta trabajadores de una cantera a los que detuvieron porque en su tarea manipulaban explosivos y los consideraron peligrosos. Las víctimas en esta causa son 34, quienes denunciaron haber sido víctimas, por ejemplo, de privación de la libertad y torturas
-Nívoli
Incluye casos de arrestos a estudiantes, gremialistas y dirigentes políticos con anterioridad al golpe militar del ‘76, es decir que se trata de detenciones ilegales y de torturas que se habrían producido en la etapa democrática previa a la caída del Gobierno de Isabel Perón. Las víctimas son 24.
-Mazzitelli
Es es la causa que incluye a las personas desaparecidas en la provincia que, según los registros de la Justicia Federal, suman 20. Los imputados son 12 y la cantidad de víctimas suman 42.
-Cevinelli
Es el caso por la detención, la privación de la libertad y las torturas que sufrió Héctor Cevinelli, actual docente de la UNSJ. Era un militante del peronismo de izquierda y fue apresado el 12 de marzo de 1977 en su casa del Barrio Sargento Cabral, en Rivadavia, por un grupo armado cuyos integrantes estaban vestidos de civil. Fue liberado el 4 de abril de ese año cerca de Chepes, en La Rioja.
-Yannello
Al exfiscal federal de San Juan le atribuyen la figura penal de “incumplimiento de la obligación de perseguir delincuentes”. Es porque lo acusan de no haber denunciado ni promovido investigaciones sobre torturas y desapariciones de detenidos.