Enrique Hrabina comenzó su carrera como entrenador en 1992. Lo hizo como no podía ser de otra manera en Boca, donde fue uno de los emblemas del equipo y el lugar donde se retiró como jugador. Quique fue técnico interino del plantel superior del Xeneize y después dirigió de forma alternada la Tercera División y la Reserva, hasta 1995. Un año más tarde pasó por Tigre, luego por Almagro (1998, 2000 y 2003), San Telmo (1999), Almirante Brown de Arrecifes (2001), Instituto de Córdoba (2003), en este caso como ayudante de campo de Jorge Higuaín, en su única experiencia en el interior del país.
En el 2003 formó dupla con Juan Amador Sánchez en Alamgro y obtuvo el ascenso a Primera División al año siguiente. Posteriormente se fue a Guaraní de Paraguay donde salió subcampeón del Torneo Apertura de ese país en 2005, logro que le posibilitó al club participar de la Copa Sudamericana.
Su último trabajo fue en Los Andes, también en la B Nacional, club al que renunció en marzo de este año.
