Las investigaciones que realiza el "Instituto de investigaciones Arqueológicas" se canalizan por el programa "Conocimiento y difusión de la prehistoria de San Juan". Desde hace casi 40 años estas investigaciones han permitido armar el gran esquema de la prehistoria de San Juan desde 8.500 años antes del presente hasta la llegada de la conquista española y conocer con más detalle varias de sus etapas más significativas. Por medio de la exhibición museográfica, de las publicaciones científicas y de divulgación y de la docencia universitaria, estos conocimientos llegan rápidamente a la comunidad.