A consecuencia de las recurrentes quejas de los turistas en la temporada 2008/2009 -récord de tránsito con 31.904 personas que utilizaron el Paso de Agua Negra- que debían esperar en temporada alta hasta 4 o 5 horas para completar el trámite, el gobierno provincial y las autoridades competentes decidieron encarar algunas mejoras en el destacamento de Las Flores. Reacondicionaron el edificio e instalaron antenas y equipos de comunicación, además de afectar a una persona más por tarea. Hasta entonces, el destacamento argentino contaba con 12 efectivos de Gendarmería Nacional que estaban encargados de la seguridad y apenas un inspector de Migraciones. En tanto que de Aduana había 3 personas para la labor de autorización del trámite de entrada y salida de personas, vehículos y mercadería.
