El formato de este Torneo de Transición en el Federal A es extenso y premia con un solo ascenso a la B Nacional, castigando con dos descensos al Federal B a mediados del año, con riesgos y oportunidades para todos.
Primera Fase: Se llevará a cabo por el sistema de adición de puntos en cada una de las zonas, las cuales jugarán todos contra todos a tres (3) ruedas (dentro de su zona). Clasifican a las fases restantes del primero al segundo de cada zona; y, los dos mejores terceros.
Segunda Fase: Estará integrada por los dieciséis (16) clubes. Se disputará por eliminación directa, a doble partido uno en cada sede. Harán de local en el primer partido las posiciones 9º, 10º, 11º, 12º, 13º, 14°, 15º, 16º.
Tercera Fase: Estará integrada por los ocho (8) clubes ganadores de la Segunda Fase y se utilizará el mismo ordenamiento ya detallado (ubicados del 1º al 8º). Se disputará por eliminación directa, a doble partido uno en cada sede. Harán de local en el primer partido las posiciones 5°, 6°, 7º y 8°.
Cuarta Fase: Estará integrada por los cuatro (4) clubes ganadores de la Tercera Fase y se utilizará el mismo ordenamiento ya detallado.
Se disputará por eliminación directa, a doble partido uno en cada sede. Harán de local en el primer partido las posiciones 3º y 4º
Quinta Fase: Estará integrada por los dos (2) clubes ganadores de la Cuarta Fase. Se disputará por eliminación directa, a doble partido uno en cada sede y el ganador ascenderá a la Primera B Nacional.
Descenso
Finalizada la Primera Fase se confeccionará la Tabla General de Puntos, descendiendo al Torneo Federal B 2016/17 los clubes ubicados en la posición 34 y 35. En caso de empate en puntos entre dos o más clubes en esas posiciones se realizarán partidos definitorios entre ellos.